1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
1.1本课题的意义我国的绵羊、山羊品种丰富,仅列入《中国羊品种志》的品种就有35个(绵羊15个,山羊20个),加上列入各省《畜禽品种志》的地方绵羊、山羊品种达80多个。
目前中国绵羊、山羊的饲养量、出栏量、羊肉产量、皮产量以及山羊绒产量均居世界第一位。
[1]繁殖性状是养殖业的终于经济性状之一,山羊的繁殖性状遗传力低、繁殖周期长、选育进展慢。
2. 研究的基本内容和问题
2.1研究目标 通过利用高通量测序技术对经RNA反转录及PCR扩增得到的cDNA进行测序分析,检测山羊不同直径卵泡的基因差异表达情况,通过GO功能显著性富集分析及Phthway显著性富集分析,得出差异表达基因编码的蛋白具有的功能和差异表达基因中显著性富集的信号通路,为改善山羊的繁殖性能和提高产仔数等提供理论支持。
2.2研究内容2.2.1不同直径卵泡RMA的提取质量检测用紫外分光光度计检测提取的不同直径卵泡RNA的OD260/OD280值,其比值应处于1.8-2.0之间。
表明提取的RNA无DNA及蛋白质污染。
3. 研究的方法与方案
3.1研究方法 本实验拟用5只体型、健康状况、年龄为7个月龄大的长江三角洲白山羊,宰杀后取卵巢的各级卵泡组织,包括原始卵泡、初级卵泡、次级卵泡、成熟卵泡,迅速投入液氮(-70℃)保存,使用Illumina Hi SeqTM2000 测序仪(美国)进行测序。
3.2技术路线、实验方案样本RNA采集-cDNA建库-Illumina测序-与参考基因组比对及基因表达量分析-基因的GO功能显著性富集分析及Phthway显著性富集分析-荧光定量PCR(RT-PCR)验证。
3.3可行性分析实验农场饲养山羊条件完备,代理本课题卵泡转录组测序的转录组测序公司设备俱全,实验室具备其他相应的实验仪器与实验试剂,实验具有可行性。
4. 研究创新点
以往,国内外针对羊的卵泡发育过程中的基因表达差异研究多数以RT-PCR技术、PCR-SSCP技术等对单个或者多个基因作定位检测,本课题采用的是转录组测序,该技术不仅具备:可提供全基因组范围的数字化信号的基因表达谱、高灵敏度、任意物种的全基因组分析、更广的检测范围等优势,而且其成本通常比芯片和大规模的Sanger EST测序要低。
5. 研究计划与进展
2016年9月2016年10月 查阅文献,探讨国内外研究进展;2016年10月2017年1月 完善实验计划,熟悉实验操作; 2017年1月2017年3月 正式实验,记录整理实验数据; 2017年3月2017年5月 分析实验结果,撰写实验报告,完成结题工作。
以上是毕业论文开题报告,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。