棉花脂肪酸脱饱和酶(FAD)基因家族的全基因组鉴定及FAD2类基因的表达分析开题报告

 2023-02-10 16:12:14

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1.本课题的意义植物种子的脂肪酸组成决定了油的品质和用途,对脂肪酸去饱和酶(FAD)及其编码基因的研究能够极大地推动油脂的品质改良,具有很高的经济和实用价值。

棉花不仅是重要的纤维作物,也是重要的油料作物。

棉籽作为棉花的副产物,其种子含油量约25%到40%[1],是重要的植物油料资源。

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2. 研究的基本内容和问题

1.研究的目标1)学习实验室的规章制度和各项生物技术,及各种实验仪器的使用。

2)了解植物脂肪酸代谢途径,特别是本研究涉及到的脂肪酸去饱和酶基因的研究现状有个大致的认识和了解。

3)按实验计划完成各项实验任务,完成FAD基因的全基因组扫描及组织表达分析。

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3. 研究的方法与方案

1.研究方法1)棉花二倍体野生种雷蒙德氏棉全基因组数据下载于Phytozome网站(http://www.phytozome.net/)。

FAD家族基因的发掘使用Pfam数据库工具,获得其保守结构域的种子文件,再通过HMMER 3.0 软件检索已有的数据库。

2)采用GSDS程序完成基因结构分析。

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4. 研究创新点

近些年来,对于棉花的分子生物学研究主要集中在改良棉纤维的产量和品质方面,而对棉籽油组分的研究相对缺乏。

随着D基因组雷蒙德氏棉全基因组的测序完成,对我们发掘棉籽油代谢过程中的关键基因提供了极大地便利,本项目将在全基因组水平对FAD基因进行发掘,并对发掘到的基因进行生物信息学分析和组织器官表达分析,以期能筛选到棉花种子发育过程中优势表达的基因。

5. 研究计划与进展

1.研究计划1)相关文献的查阅,以及一些生物学软件的学习3) 在D亚组雷蒙德氏棉数据库中对FAD基因家族成员进行全基因组发掘以及生物信息学分析。

4)以南农棉花所已有的陆地棉7235为研究材料,提取各个组织器官以及不同发育时期的胚珠和纤维的总RNA。

利用荧光定量PCR对FAD基因家族成员进行组织表达特异性分析。

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